SELECTIVE TRANSCRIPTOMIC VULNERABILITY OF MEMBRANE-INTEGRATED ARCHITECTURES DURING NEURAL TISSUE VITRIFICATION

Este estudio revela que la vitrificación de tejidos neurales induce una vulnerabilidad transcripcional selectiva y estructurada, afectando desproporcionadamente a los ARNm asociados con arquitecturas de membrana y vías secretoras, especialmente en el hipocampo, lo que subraya la necesidad de evaluaciones a nivel de transcripción para optimizar los métodos de criopreservación.

Wilczok, D., Long, Q., Huang, Z. + 3 more2026-03-30📄 molecular biology

Whole-genome pre-amplification as a viable approach for genomic screening of FFPE-derived DNA samples

El estudio demuestra que la amplificación pre-genómica DLMDA permite recuperar grandes cantidades de ADN de muestras FFPE preservando los patrones de alteración del número de copias (CNA) y evitando artefactos, aunque reduce la sensibilidad para detectar dichas alteraciones, lo que la hace viable para cribados genómicos pero requiere mejoras para minimizar los falsos negativos.

Guerrero Quiles, C., Lodhi, T., Sellers, R. + 17 more2026-03-29📄 molecular biology

Long-term stability of RNA nucleoside standards for accurate LC-MS quantification

Este estudio evalúa la estabilidad a largo plazo de 44 nucleósidos de ARN en solución acuosa, identifica problemas de pureza y degradación en compuestos específicos, correlaciona los hallazgos experimentales con cálculos cuánticos y propone directrices prácticas para mejorar la fiabilidad y comparabilidad interlaboratorial del análisis de modificaciones de ARN mediante LC-MS.

Kerkhoff, K., Wesseling, H., Qi, Y. + 6 more2026-03-28📄 molecular biology

Epitranscriptomic profiling of VSMC phenotypes reveals uridine modifications linked to post-transcriptional regulation

Este estudio demuestra que las transiciones fenotípicas de las células musculares lisas vasculares hacia estados proinflamatorios o atheroprotectores están reguladas por paisajes epitranscriptómicos distintos, destacando la presencia de modificaciones de uridina en el estado proinflamatorio que influyen en la regulación postranscripcional.

Reinberger, T., Ismail, A., Falk, T. + 5 more2026-03-28📄 molecular biology

Barcode Crosstalk in ONT Multiplex Sequencing: Quantification and Mitigation Strategies

Este estudio cuantifica el problema de la interferencia entre códigos de barras (crosstalk) en la secuenciación multiplex de ONT, demostrando que el protocolo estándar antiguo presenta tasas de error significativas en muestras con baja concentración de ADN, mientras que las nuevas versiones de ONT y un protocolo casero de pooling posterior a la ligación reducen o eliminan casi por completo este efecto.

Scharf, S. A., Spohr, P., Ried, M. J. + 4 more2026-03-28📄 molecular biology

Chromatin remodelling enables enhancer resetting to facilitate the ERK transcriptional response

Este estudio demuestra que la señalización de ERK en células madre embrionarias de ratón induce un "reset" rápido de los potenciadores mediante la liberación de la ARN polimerasa II pausada y la remodelación de la cromatina dependiente del complejo NuRD, un mecanismo esencial para establecer una topología de potenciadores estable que permita respuestas transcripcionales precisas y rápidas durante la determinación del destino celular.

Ragheb, R., Reynolds, N., Shah, D. + 9 more2026-03-28📄 molecular biology

Expansion and optimization of the auxin-inducible degron 2 (AID2) system in Candida pathogens

Los autores expanden y optimizan el sistema de degradación inducible por auxina (AID2) para su aplicación en cepas prototróficas clínicas de *Candida albicans* y en *Candida auris*, mediante el desarrollo de nuevos vectores, estrategias de edición genética mejoradas y cassetes de etiquetado todo-en-uno que facilitan la investigación en patógenos de *Candida*.

Danzeisen, E. L., Lihon, M. V., Milholland, K. L. + 3 more2026-03-28📄 molecular biology

Label-free toehold mediated strand displacement on 3D printed hybrid paper-polymer platform for protein sensing

Este estudio presenta un dispositivo híbrido de papel y polímero impreso en 3D que utiliza una puerta lógica de ADN mediada por desplazamiento de cadena para detectar de forma sensible y específica el factor de crecimiento derivado de plaquetas BB (PDGF BB) mediante fluorescencia, logrando un límite de detección de 10 pM relevante para el diagnóstico de preeclampsia.

Ngaju, P., Kakadiya, D., Abdollahi, S. + 2 more2026-03-28📄 molecular biology

Vitamin D3 attenuates nitrogen mustard-induced dermal toxicity by enhancing microbial butyrate production via the intestinal VDR-α-defensin signaling pathway

La vitamina D3 atenúa la toxicidad dérmica inducida por gas mostaza nitrogenado al remodelar la microbiota intestinal para enriquecer *Akkermansia muciniphila* y aumentar la producción de butirato, un mecanismo mediado por la vía de señalización intestinal VDR-α-defensina.

Dong, X., He, Y., Hu, X. + 14 more2026-03-27📄 molecular biology

Identification of a microRNA with a mutation in the loop structure in the silkworm Bombyx mori

Este estudio identifica una mutación en la estructura de bucle del microARN miR-3260 en el gusano de seda *Bombyx mori* asociada a una piel larvaria translúcida, y descubre que dicha alteración impide la escisión mediada por Dicer sin afectar la expresión de genes relacionados con la hormona juvenil ni inducir fenotipos característicos.

Harada, M., Tabara, M., Kuriyama, K. + 8 more2026-03-27📄 molecular biology

Genome-wide analysis of Heavy metal ATPase (P1B-type ATPase) gene family in Mung bean and their expression analysis under heavy metal (Zn, Cd and Cu) stress

Este estudio realiza un análisis genómico integral de la familia de genes HMA en el frijol mungo, identificando nueve miembros, caracterizando sus propiedades estructurales y demostrando su expresión diferencial bajo estrés por metales pesados (Zn, Cd y Cu), lo que sugiere su papel crucial en la homeostasis de metales y ofrece una base para la mejora genética de la tolerancia a metales en este cultivo.

Panigrahi, J., Panigrahy, D., Rath, B. + 1 more2026-03-27📄 molecular biology

Identification of Parkinson's disease-associated regulatory variants in human dopaminergic neurons reveals modulators of SCARB2 and BAG3 expression

Este estudio identifica variantes regulatorias asociadas a la enfermedad de Parkinson en neuronas dopaminérgicas humanas, demostrando que las variantes de riesgo en los loci *SCARB2* y *BAG3* alteran la accesibilidad de la cromatina y la unión de factores de transcripción, lo que reduce la expresión génica y ofrece una visión mecanicista de la patología.

Gerard, D., Ohnmacht, J., Gomez Ramos, B. + 15 more2026-03-27📄 molecular biology

lncOriL, a novel polyadenylated mitochondrial lncRNA common to zebrafish and human

Mediante secuenciación de ARN directo de lectura larga, este estudio identifica y caracteriza lncOriL, una nueva ARN largo no codificante poliadenilado de origen mitocondrial que, junto con modificaciones específicas en los ARNm de COI y ND5, se expresa de forma conservada en teleósteos y vertebrados superiores, incluidos los humanos.

Jorgensen, T. E., Wardale, A., Wolf Profant, S. + 7 more2026-03-27📄 molecular biology